通常缺碘症的表现取决于缺碘的程度、持续时间以及患病的年龄。新生儿则表现为甲状腺功能低下，儿童和青春期则引起地方性甲状腺肿、地方性甲状腺功能减低症以及单纯性聋哑，成人期缺碘会出现食欲减退、无力、易疲劳、体能下降等症状。
胎儿期缺碘可导致发育不良，脑和神经发育障碍，重者造成大脑发育不可逆转损害，如克汀病、亚克汀病，出生后表现为身材矮小、黏液、水肿、不同程度的智力伤残直至白痴、单纯性耳聋、斜视、步态共济失调等。