眼睛下面长了扁平疣可以通过采取干扰素凝胶，并采取激光去除。扁平疣主要是由人类乳头瘤病毒引起，好发于青少年的面部、手背和前臂。
对于眼底下出现扁平疣的患者，首先要明确其临床诊断是正确的，再进行临床治疗。若疣体较小，可以采用外用药膏进行治疗，例如干扰素凝胶、0.1%的维A酸软膏、5%的米奎莫特霜等，对于面积较大的患者，可以采用二氧化碳激光、微波、电灼或冷冻等方法治疗。
也可以采用皮损内注射博莱霉素等进行治疗，用药谨遵医嘱。