结肠炎是与免疫因素具有密切相关性的一类炎性肠病，它的治疗比较困难，很难彻底根治，而且容易常年反反复复发作。治疗时可通过左氧氟沙星、蒙脱石散、美沙拉秦等药物治疗。
急性结肠炎在发作时容易出现腹泻现象，治疗时可以服用蒙脱石散，如果是慢性的结肠炎，可以选择磺胺类的药物如美沙拉嗪栓等磺胺类栓剂。
病情严重的再加用免疫调节剂，有并发症的可以考虑手术治疗。发生结肠炎，应按医生要求完善检查，明确病因，并及时进行治疗。