脑干手术成功率不大，通常在30%以下，手术的难度较大，主要取决于病变性质，部位以及肿瘤大小。大脑干肿瘤在以往被认为是手术“禁区，这是因为脑干在很小的范围内集中有许多神经核团、传导束和网状结构等。
脑干肿瘤多为浸润性生长的胶质细胞瘤，因而手术困难较大，易造成脑干内的重要结构损伤，手术致残及手术死亡率较高，预后不良。
近年来随着显微神经外科技术的迅速发展，使脑干肿瘤手术效果明显改善。尽管脑干肿瘤手术仍有较大风险，但对于较局限、呈结节状或囊性变、分化较好的肿瘤，应积极采用手术切除，其预后较好。
对于良性型的脑干肿瘤，采取全切除手术方式是可以获得根治效果的。建议患者定期体检，要尽早发现，尽早治疗。也要对手术有信心。