腹泻后肛门疼痛的原因如下：
1、如果不注意饮食，长期饮酒或吃辣椒等辛辣食物，会引起痔疮肿胀，引起肛门周围的刺激和肿痛。排便后常出现屁眼疼痛，应及时做直肠指检，必要时做肠镜检查，查明原因。
2、肛腺感染后，沿肛管扩散至肛门周围皮肤，形成肛周脓肿，排便时肛门会特别疼痛。
3、患者通常大便干燥，容易损伤肛管皮肤，导致肛裂。此时大便增加腹压，容易损伤肛裂创面，引起疼痛。可能患有混合痔，这是静脉血管曲张。如果是三期或四期痔疮，痔疮容易从肛门出来，有时时间长了，引起痔静脉充血肿胀，排便时引起肛门周围疼痛。出现不适请及时就医。