牙齿涂氟最大的副作用就是可能会因为氟的摄入量过高引起氟中毒，但是一般来讲正常使用没有明显的副作用。牙齿涂氟化物，目的是为了防止牙齿过早的发生龋坏，维护牙齿健康。
并且因为是局部使用药物治疗，这样的话对身体的整体健康，一般不会造成影响。其实涂氟基本没有什么副作用，以前用氟泡沫时，有的可能会对氟泡沫敏感或者恶心，有不适的表现。
但现在用改良型的氟凝胶后，副作用相对已经小得多，副作用可能有一过性的呕吐，或者恶心，是一过性的反应，不会有后遗症问题。