幽门螺杆菌阳性可通过质子泵抑制剂、铋剂类药物，并配合两种抗生素进行根治。质子泵抑制剂类药物有奥美拉唑、雷贝拉唑，能作用于患者胃壁的质子泵上减轻胃酸的分泌，铋剂药物有枸橼酸铋钾颗粒。
抗生素可选择阿莫西林、甲硝唑，连续用药两周，停药一个月时间再次到医院复查，测试呈阴性就代表治愈了。以上药物需在医生指导下进行使用，不可自行使用，以免产生不良反应，幽门螺杆菌阳性患者，需及时就医，以免延误治疗。