幽门螺杆菌的第二次复发需要及时检查，进行第二次治疗，并做好预防护理。幽门螺杆菌的第二次复发大部分是因为根除失败，也就是说，当时没有实际根除幽门螺杆菌，6个月或1年后，如果发现和感染、体检呈阳性，就要去医院检查。
没有根除治疗的禁忌症，没有抗衡因素，就需要进行治疗。尤其是对年轻患者，如果不根除，长期胃黏膜持续慢性炎症会增加萎缩性胃炎，提高胃癌发生的概率。
患者根除幽门螺杆菌后仍然是易感者，因此要注意预防再感染，还需要分食、勤洗手、改善卫生条件，并定期检查。